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,ssr标记具有分布随机、数量丰富、信息含量高、等位基因变异多、共显性遗传、稳定性好、操作简便优点

[导读]简单重复序列(simple sequence repeats,ssrs),是一种广泛存在于原核生物和真核生物基因组中的串联重复序列.其重复单元一般由2~6个核苷酸组成,目前已广泛应用于遗传图谱构建、分子标记辅助选择育种、遗传多样性分析和品种鉴定等领域。

试验方法;dna提取:利用植物dna提取试剂盒,1%琼脂糖凝胶电泳检测dna的完整性,nanodrop 2000微量紫外-可见分光光度计检测dna的浓度和纯度,选择无降解、纯度高的dna样品用于后续试验。est-ssr位点筛选及引物设计;pcr扩增及引物筛选:对est-ssr引物进行初步筛选,pcr反应体系为10.0 ul:2×taq master mix 5 ul;10 umoll的正向引物(f)和反向引物(r)格0.5ul30 ~50 ng/pl的模板dna1 pl;ddhzp03山l,为减少非特异性扩晨本试验采用touchdownrpcr租序95℃预变性 3 min,95等变性.30s65℃退火60s (每一循环减1c)72℃延伸10 s共10个循环%5℃变性30 s5~82℃退火60 s 引物的,,72℃延伸bo0s共30个循环,72℃继续延伸5min,首先采用15%的琼脂糖凝胶电泳检测是否扩增成功其次采用8%的聚丙烯酰胺凝胶电泳筛选具有多态性的引物最后选择多态性引物对125个ril家系进行pcr扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳。






 



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